성요셉여자중고등학교의 뿌리는 금릉중학교에서 시작되었다. 금릉중학교는 광복 이후 강진 지역 유지들의 뜻을 모아 남성리에 개교하였으며, 학급증설을 위해 현재 위치의 평동리로 교사를 신축·이전하고 정식 인가를 받았다.

이후 금릉여자중학교로 정관을 변경하여 강진 지역 여성교육의 기반을 마련하였다. 그러나 1960년대 재정난 등으로 어려움을 겪게 되면서 1961년 학교는 천주교 광주대교구 교육재단으로 이양되었고, 교육운영은 '사랑의 씨튼 수녀회'에 위탁하였다.

사랑의 시튼 수녀회는 1962년 금릉여자중학교를 정식 인수하여 성요셉금릉여자중학교로 교명을 변경하였으며, 성요셉금릉여자가정고등학교를 신설하여 토마스 아퀴나스 수녀가 중고등학교 교장으로 취임하였다.

사랑의 씨튼 수녀회는 고등학교 설립 당시부터 외국어 교육과 실습 교육 등 선진교육을 도입하였으며 학부모님들의 요청과 변화하는 사회 환경에 발맞추어 상업계열을 포함한 종합고 체계로 전환을 모색하여 1973년 성요셉여자종합고등학교로, 이어 2001년에는 성요셉여자중고등학교로 교명을 변경하였다. 공교육이 강화됨에 따라 성요셉금릉여자중학교는 1988년 40회 졸업으로 폐교되었고, 성요셉여자중고등학교는 농어촌 인구감소로 인한 학생수 급감이라는 시대적 흐름 속에서 2016년 제52회 졸업식을 마지막으로 폐교되었다.

성요셉여자중고등학교는 강진 지역의 여성 교육을 위해 54년간 선구자적인 역할을 했으며 여성교육의 요람으로 자리매김하였다.